Toponome とは

トポポームは、形態学的に無傷の細胞および組織におけるタンパク質および他の生体分子の空間ネットワークコードである。それは、1つの試料(組織切片または細胞の高分解能での細胞試料)中の数千の超分子を同一位置で共同マッピングすることができるイメージングサイクラー顕微鏡(ICM)によってマッピングおよびデコードされる。 「トポポーム」という用語は、古代ギリシャの名詞「topos」(場所、位置)と「nomos」(νόμος;法律)から由来し、用語「トポノミクス」はトポポームの研究を指します。これは2003年にWalter Schubertによって紹介されました。細胞と組織における生体分子のネットワークは、調整された行動を可能にするトポロジカルなルールに従っているという事実に対処しています。例えば、細胞表面トポポームは、細胞運動の実行のための空間タンパク質相互作用コード、すなわち「行動規範」を提供する。これは、細胞表面膜に沿った特定の空間的秩序を有する超分子の類似した組成および異なる組成の特定の空間的配置(組成周期性)に本質的に依存する。この空間的順序は、細胞が球状状態(空間周期性)から探索状態に入ることを試みるときに周期的に繰り返される。この空間トポポームコードは、鉛生体分子、抗コロケート(存在しない)生体分子および鉛生体分子に可変に関連するワイルドカード分子を用いて階層的に組織化されている。表面膜における鉛分子の阻害は、対応する生体分子ネットワークの分解および機能の喪失につながることが示されている。