CAFASP とは

CAFASP、または完全自動構造予測の重要な評価は、タンパク質構造予測の大規模なブラインド実験であり、ホモロジーモデリング、フォールド認識、およびタンパク質立体構造のab initio予測における自動構造予測ウェブサーバーのパフォーマンスを、アミノ酸配列。この実験は、人間の介入と専門知識を組み込んだ予測に焦点を当てたCASPと並行して、2年に1回実行されます。 CAFASPは、Protein Data Bankに新たに導入されたタンパク質構造に対して週に1回実行される関連ベンチマーク手法であるLiveBenchとEVAと比較すると、はるかに少ないデータを生成しますが、人間の予測専門家によって生成された予測と直接比較できる予測が得られます。最近CAFASPは、別の実験としてではなく、CASP結果に基本的に統合されて実行されています。