Template modeling score とは

バイオインフォマティクスでは、テンプレートモデリングスコアまたはTMスコアは、異なる3次構造を有する2つのタンパク質構造間の類似性の尺度である。 TMスコアは、しばしば使用されるRMSDおよびGDT測定よりも全長タンパク質構造の品質のより正確な尺度として意図される。 TMスコアは、2つの構造間の差を ( 0 , 1 ] {\displaystyle (0,1]} の間のスコアで示します.1は2つの構造間の完全一致を示します(したがって、高いほど良い)。一般に、0.20未満のスコアは無作為に選択された無関係のタンパク質に対応し、0.5より高いスコアを有する構造はほぼ同じ倍を前提とする。定量的研究は、TMスコア= 0.5のタンパク質が同じCATHトポロジーファミリーで37%の事後確率を有し、同じSCOP倍のファミリーにおいて13%の事後確率を有することを示す。確率はTMスコアが0.5を超えると急速に増加する。 TMスコアはタンパク質の長さとは無関係に設計されている。