TopHat (bioinformatics) とは

TopHatは、最初にBowtieを用いてトランスクリプトーム技術(例えばRNA-Seq)によって生成されたショットガンcDNAシークエンシングリードを高速かつ高スループットでアライメントするためのバイオインフォマティクス配列分析パッケージツールである。 TopHatは、RNA-Seqの読みを哺乳類サイズのゲノムに整列させます。
TopHatは無料のオープンソースソフトウェアです。 http://tophat.cbcb.umd.eduから入手できます。