Fast statistical alignment とは

FSAは、多くのタンパク質またはRNAまたは長いゲノムDNA配列を整列させるためのマルチプルシーケンスアラインメントプログラムです。 MUSCLEとMAFFTに加えて、FSAは数百または数千の配列のデータセットを整列させることができる少数の配列整列プログラムの1つです。 FSAは、これらの他のプログラムよりも非相同性配列をより確実に同定することを可能にする異なる最適化基準を使用するが、この増加した精度は速度の低下を犠牲にして生じる。
FSAは現在、新しいワームゲノムの配列決定やハエのin vivo転写因子結合解析などのプロジェクトに使用されています。