塩基呼び出しは、塩基（核酸塩基）をクロマトグラムのピークに割り当てるプロセスです。この仕事を達成するためのコンピュータプログラムの1つはPhred base-callingです。これはベースコールの精度が高いため、学術および商業の両方のDNAシーケンシングラボで広く使用されているベースコールソフトウェアプログラムです。