Protein–ligand docking とは

タンパク質 – リガンドドッキングは、分子モデリング技術である。タンパク質 – リガンドドッキングの目的は、リガンド(小分子)がタンパク質受容体または酵素に結合したときの位置および配向を予測することである。医薬品の研究では、様々な目的でドッキング技術を採用しています。とりわけ、有望な薬剤候補を選択するために利用可能な化学物質の大きなデータベースを仮想的にスクリーニングすることです。
AutoDock、rDock(フリーおよびオープンソース)、EADockなど、いくつかのタンパク質 – リガンドドッキングソフトウェアアプリケーションが利用可能です。タンパク質と相互作用する小分子の部位、形状、エネルギーを計算するウェブサービス(分子ドッキングサーバ、SwissDock)もあります。