Yass (software) とは

YASSは、ヌクレオチド配列に対するフリーソフトウェアのペアワイズ配列アライメントソフトウェアであり、DNA配列またはRNA配列間の類似性を検索することができます。 YASSは、プレーンテキストまたはFASTAフォーマットのいずれかでヌクレオチド配列を受け取り、出力フォーマットはBLAST表出力を含む。 YASSは、いくつかの遷移が制限された間隔を置いて配置されたシードk-merを使用しており、感度が大幅に改善されています。 YASSは、ユーザーのマシン上でローカルに、またはブラウザベースのドットプロットを生成するYASS Webサーバー上のSaaSとして使用できます。