Docking (molecular) とは

分子モデリングの分野では、ドッキングは、互いに結合して安定な複合体を形成する場合に、1分子の優先配向を2番目に予測する方法である。好ましい配向の知識は、例えばスコアリング機能を用いて2つの分子間の結合または結合親和力を予測するために使用され得る。
タンパク質、核酸、炭水化物、脂質などの生物学的に関連性のある分子間の関連性は、シグナル伝達において中心的な役割を果たす。さらに、2つの相互作用するパートナーの相対的配向は、産生されるシグナルのタイプ(例えば、アゴニズム対拮抗)に影響し得る。したがって、ドッキングは、生成される信号の強度およびタイプの両方を予測するのに有用である。
分子ドッキングは、適切な標的結合部位への小分子リガンドの結合形態を予測する能力のために、構造ベースの薬物設計において最も頻繁に使用される方法の1つである。結合挙動の特徴付けは、薬物の合理的設計ならびに基本的な生化学プロセスを解明する上で重要な役割を果たす。