GeneRIF とは

GeneRIFまたはGene Reference Functionには、遺伝子の機能に関する短い文(255文字以下)があります。 GeneRIFは、科学者がEntrez Geneデータベースに記述された遺伝子の機能注釈を加えることを可能にする簡単なメカニズムを提供する。実際には、機能はかなり広く解釈される。例えば、疾患における遺伝子の役割を論じるGeneRIF、遺伝子についてのレビュー記事に目を向けるGeneRIF、および遺伝子の構造を議論するGeneRIFがある。しかしながら、GeneRIFsが遺伝子機能に関するものであることが記載されている。現在、約1000種類以上の遺伝子からの遺伝子リボソームが50万個以上作成されています。
GeneRIFは常にEntrez Geneデータベースの特定のエントリーに関連付けられています。各GeneRIFには、GeneRIFが作成した声明の証拠となる科学刊行物のPubMed ID(文書識別子の一種)へのポインタがあります。 GeneRIFは、PubMed IDで識別される文書から直接抽出されることが多く、タイトルまたは最終文から頻繁に抽出されます。
GeneRIFは、通常、NCBIインデクサーによって産生されるが、誰でもGeneRIFを提出することができる。処理するためには、特定の遺伝子に対して有効な遺伝子IDが存在していなければなりません。あるいは、遺伝子担当者はその種に遺伝子ID全体を割り当てていなければなりません。後者の場合は、NEWENTRYという記号を持つGeneのレコードを介して実装されます。 Gene IDが特定されると、提出を完了するために必要な情報は3種類だけです。
 機能を記述する簡潔なフレーズ(長さが255文字未満、好ましくは紙のタイトルの再記述以上)。 PubMedの引用のPubMed IDを提供することによって実装された、その機能を記述した出版された論文。有効な電子メールアドレス(秘密のままです)。