HHスイートは、高感度のタンパク質配列検索のためのオープンソースのソフトウェアパッケージです。これには、タンパク質配列データベース内の類似のタンパク質配列を検索できるプログラムが含まれています。配列検索は、未知のタンパク質の機能が類似の配列を有するタンパク質の機能から推測される現代生物学における標準的なツールである。