Knotted protein とは

結び目のあるタンパク質は、その骨格が結び目に絡んでいるタンパク質です。両端の文字列を引っ張るように、両方の末端からタンパク質鎖を引っ張ると想像することができます。ノットされたタンパク質が両方の末端から「引っ張られる」と、それは解かれない。結び目のあるタンパク質は非常にまれであり、それらの折りたたみのメカニズムと機能はよく理解されていないので興味深い。いくつかの解答を示唆するいくつかの実験的および理論的研究があったが、これらの質問に対する体系的な答えは見出されていない。
タンパク質ノットを検出するための多くの計算方法が開発されているが、X線構造または非標準的なPDBフォーマットにおける欠損残基または連鎖切断のために必要な手動介入なしにタンパク質ノットを検出する完全な自動方法は依然として存在しない。
タンパク質で発見された結び目の大部分は深い三つ葉(31)結び目です。図8ノット(42)、3ツイストノット(52)、スティーブノアノット(61)も発見されている。