SCHEMA (bioinformatics) とは

SCHEMAは、タンパク質の3次元構造の完全性を乱すことなく再結合できるタンパク質の断片(スキーマと呼ばれる)を同定するためにタンパク質工学で使用される計算アルゴリズムです。このアルゴリズムは、タンパク質の異なるアミノ酸残基間の相互作用を計算して、タンパク質の構造ドメインを交換することによってどの相互作用が破壊されるかを決定する。これらの破壊を最小限に抑えることにより、SCHEMAは、安定に折り畳まれ、親タンパク質と比較して機能が変化している可能性があるキメラタンパク質を設計するために使用することができる。 SCHEMAアルゴリズムは遠くに関連するβ-ラクタマーゼの組換えライブラリーに適用されている。