Bioclipse とは

BioclipseプロジェクトはEclipseベースのリッチクライアントプラットフォーム(RCP)をベースにした化学/バイオインフォマティクスのためのJavaベースのオープンソースのビジュアルプラットフォームです。 2009年にはスクリプト機能が追加されました。
他のRCPアプリケーションと同様に、Bioclipseはヘルプシステム、ソフトウェアアップデート、プリファレンス、クロスプラットフォームデプロイメントなどEclipseからの基本的な機能とビジュアルインタフェースを継承するプラグインアーキテクチャを使用します。プラグインを介して、Bioclipseは化学およびバイオインフォマティクス追加機能を提供するために、他のプロプライエタリなプラグインによって容易に拡張できる拡張ポイント。
Bioclipseの最初の安定版には、化学情報のバックエンドを提供するChemistry Development Kit(CDK)プラグイン、分子の3D可視化のためのJmolプラグイン、シーケンス分析のためのBioJavaプラグインが含まれます。最近、StatETとOpenToxを使用したRプラットフォームが追加されました。
Bioclipseは、Proteochemometric Group、Uppsala University、Sweden、European Biinformatics InstituteのChristoph Steinbeck Group、およびライデン大学のAnalytical Chemistry Departmentの間の共同開発として開発されていますが、他の学術機関Karolinska Institutetとマーストリヒト大学を含む。この開発は、国際生物兵器協会(International Bioclipse Association)によってバックアップされています。