Molecular graph とは

ケミカルグラフ理論および数学化学では、分子グラフまたは化学グラフは、グラフ理論の観点から化合物の構造式を表すものです。化学グラフは、その頂点が化合物の原子に対応し、エッジが化学結合に対応するラベル付きグラフである。その頂点は対応する原子の種類でラベル付けされ、エッジは結合の種類でラベル付けされます。特定の目的のために、ラベルのいずれも無視してもよい。
水素欠乏分子グラフまたは水素抑制分子グラフは、水素頂点が削除された分子グラフです。
分子グラフは、構造異性体、同じ分子式を有するが、イソペンタンおよびネオペンタンなどの非同形グラフを有する化合物を区別することができる。他方、分子グラフは、通常、結合の三次元配列に関する情報を含まないので、幾何異性体(例えば、シスおよびトランス2-ブテン)または他の立体異性体(例えば、D- L-グリセルアルデヒド)。
いくつかの重要な場合(トポロジカルインデックスの計算など)には、以下の古典的な定義で十分である:分子グラフは、化学化合物の構造式に対応して1対1の無向グラフに接続され、グラフの頂点は分子の原子およびエッジこれらの原子間の化学結合に対応する。 1つの変形は、材料を無限ユークリッドグラフ、特に周期的グラフとしての結晶として表現することである。